Em 1999 a Bahia contava com 41.798 instituições de ensino público (federais, estaduais e municipais), sem contar os particulares, sendo 13.526 destinados à educação infantile classes de alfabetização, 27.173 ao ensino fundamental e 1.102 ao ensino médio. Havia mais de 4.593.225 alunos matriculados nessas instituições dentre os quais 385.944 na educação infantil e classes de alfabetização, 3.702.727 no ensino fundamental e 504.554 no ensino médio. O estado contava e ainda conta com quatro universidadesestaduais que abrigavam, em 1999, mais de 16.000 estudantes universitários, a UNEB, a UEFS, a UESC e a UESB, e hoje já são 50.887 alunos matriculados em 375 cursos de graduação e 144 cursos de pós-graduação. Em 1999 foram matriculados 9.717 alunos nos cursos de suplência em todo o estado, curso destinado à aceleração dos estudos que não se enquadram nos padrões do ensino regular, a exemplo da idade avançada.
Sobretudo por causa das péssimas condições financeiras em que vivem a maioria dos alunos de escola pública, os índices de reprovação e abandono da escola são muito grandes. Um dos motivos do abandono é para ir trabalhar para ajudar na renda da família.
Com 97% das crianças de 7 a 14 anos na escola, a Bahia já alcançou a universalização do acesso ao ensino fundamental.
Segundo a edição de julho de 2008 do Ranking Web of World Universities, somente sete instituições de ensino superior baianas estão presentes entre as 119 melhores brasileiras que fazem parte das 5 000 melhores do mundo. Reputa-se como a melhor universidade do estado da Bahia a Universidade Federal da Bahia, que é também a melhor de todo o norte e nordeste brasileiro, ocupando o 692º lugar entre as melhores universidades do mundo, o 17º entre as latino-americanas e o 11º entre brasileiras. Após a UFBA, figura a UNIFACS que está na 3 560ª posição no mundo e 76ª no Brasil, seguida da UEFS (3 733º no mundo e 82º no Brasil), da UNEB (4 037º no mundo e 92º no Brasil), FIB (4 060º no mundo e 93º no Brasil), da UESC (4835º no mundo e 116º no Brasil) e da UESB (4 872º no mundo e 118º no Brasil).1 Já num estudo da Folha de São Paulo, em 2012, a Universidade Federal da Bahia aparece com a segunda melhor pontuação entre as universidades públicas do norte e nordeste.